Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3bQ9ES34 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube3bQ9ES34 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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