Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk4Q9ERK0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms