Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn12Q9ER56 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms