Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ndst3Q9EQH7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndst3Q9EQH7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms