Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syde1Q9DBZ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde1Q9DBZ9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms