Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx6Q9DBY5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx6Q9DBY5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx6Q9DBY5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx6Q9DBY5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx6Q9DBY5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx6Q9DBY5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx6Q9DBY5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx6Q9DBY5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx6Q9DBY5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms