Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrpraQ9DBG7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrpraQ9DBG7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms