Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc89Q9DA73 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc89Q9DA73 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms