Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D9H8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D9H8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D9H8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D9H8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D9H8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D9H8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Q9D9H8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D9H8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms