Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4bQ9D9F7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4bQ9D9F7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms