Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl4Q9D8E6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms