Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn22Q9D7U6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn22Q9D7U6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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