Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capns2Q9D7J7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Capns2Q9D7J7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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