Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn23Q9D7D7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms