Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbe1Q9D6Y9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbe1Q9D6Y9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms