Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc81Q9D5W4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms