Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn11Q9D572 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubxn11Q9D572 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms