Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc83Q9D4V3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms