Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K4

Fancd2os, FANCD2 opposite strand protein, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2osQ9D4K4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fancd2osQ9D4K4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fancd2osQ9D4K4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms