Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpn3Q9D3W4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpn3Q9D3W4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpn3Q9D3W4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms