Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx20Q9D2Y5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Snx20Q9D2Y5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Snx20Q9D2Y5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Snx20Q9D2Y5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx20Q9D2Y5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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