Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8bQ9D1F0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms