Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ss18l2Q9D174 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ss18l2Q9D174 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ss18l2Q9D174 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ss18l2Q9D174 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ss18l2Q9D174 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ss18l2Q9D174 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ss18l2Q9D174 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ss18l2Q9D174 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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