Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp3Q9D032 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp3Q9D032 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms