Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms