Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
3110001I22RikQ9CZ70 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms