Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm6Q9CZ69 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms