Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms