Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd9Q9CR00 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms