Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ykt6Q9CQW1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms