Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PsenenQ9CQR7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms