Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NepnQ9CQ76 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NepnQ9CQ76 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms