Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpa3Q9CQ71 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms