Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930519G04RikQ9CPT7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms