Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rrbp1Q99PL5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrbp1Q99PL5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms