Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GpnmbQ99P91 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GpnmbQ99P91 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms