Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rims1Q99NE5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rims1Q99NE5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms