Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl43Q99N89 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Mrpl43Q99N89 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Mrpl43Q99N89 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Mrpl43Q99N89 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl43Q99N89 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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