Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pagr1aQ99L02 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pagr1aQ99L02 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms