Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q99KU6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q99KU6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q99KU6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q99KU6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q99KU6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q99KU6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q99KU6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q99KU6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q99KU6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q99KU6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q99KU6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q99KU6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q99KU6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q99KU6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q99KU6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q99KU6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q99KU6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q99KU6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q99KU6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q99KU6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms