Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2aQ99KJ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms