Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn1Q99JR1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn1Q99JR1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms