Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan1Q99J59 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tspan1Q99J59 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan1Q99J59 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan1Q99J59 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan1Q99J59 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan1Q99J59 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan1Q99J59 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan1Q99J59 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan1Q99J59 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan1Q99J59 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan1Q99J59 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms