Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b5Q923D4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms