Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nek8Q91ZR4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms