Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NifkQ91VE6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NifkQ91VE6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms