Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3aQ8VHT7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3aQ8VHT7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3aQ8VHT7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms