Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Top1mtQ8R4U6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Top1mtQ8R4U6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Top1mtQ8R4U6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Top1mtQ8R4U6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top1mtQ8R4U6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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Top1mtQ8R4U6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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