Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mterf3Q8R3J4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms