Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hecw1Q8K4P8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hecw1Q8K4P8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hecw1Q8K4P8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms